Fusarium xylarioides, holatra entin'ny tany dia miteraka "aretin'ny kafe" izay manana tantara miteraka fahasimbana lehibe amin'ny voly kafe. Nisy ny fihanaky ny aretina tamin'ny taona 1920 izay nokarakaraina araka ny tokony ho izy. Nivondrona indray anefa io aretina io rehefa nandeha ny fotoana ka nitarika ny fipoahana izay niteraka fahasimbana goavana. Ny fikarohana teo aloha dia naneho fa ny karazana fungal causative dia mety nivoatra tamin'ny fahazoana fototarazo avy amin'ny karazana mifandraika. Ny fanadihadiana nivoaka tamin'ny 5 desambra 2024 dia nanamafy fa ny firongatry ny areti-maso matin'ny kafe dia vokatry ny fifindran'ny fototarazo mitsivalana avy amin'ny karazana fungi mifandray amin'ny Fusarium oxysporum mankany amin'ny karazana Fusarium xylarioides izay nahatonga ireo karazana holatra nivoatra sy nahazo sahaza. ny toetran'ny fifindran'ny voly izay mitarika amin'ny fiverenan'ny valan'aretina sy ny fahasimban'ny zavamaniry kafe.
Ao amin'ny génétique génétique, ny fototarazo vaovao na ny ADN dia afindra amin'ny fomba artifisialy ao amin'ny selan'ny zavamananaina iray amin'ny fampiasana vectors toy ny plasmids na viriosy novaina mba hampidirana fahaiza-manao vaovao amin'ny zavamananaina.
Amin'ny natiora, ny famindrana ny fototarazo na ny fampitana ny mombamomba ny fototarazo dia mitranga amin'ny fananahana mitsangana avy amin'ny ray aman-dreny mankany amin'ny taranany. Izany dia singa mahazatra amin'ny eukaryotes izay ahafahan'izy ireo mahazo fiovaovana ho an'ny fampifanarahana sy ny fivoarana. Ao amin'ny prokaryotes toy ny amin'ny bakteria, na izany aza, ny fitaovana fototarazo dia nafindra mitsivalana (na lateral) eo anelanelan'ny zavamananaina mitovy taranaka nefa tsy misy fananahana. Antsoina hoe fifindran'ny fototarazo horizontaly (HGT) izany ary io no hany fomba ahafahan'ny bakteria mahazo fototarazo vaovao mba hifanaraka amin'ny fanerena fifantenana ratsy sy hivoatra mba ho velona. Mety hitranga izany amin'ny alàlan'ny famindrana ADN avy amin'ny tontolo iainana sy ny fampidirana azy amin'ny krômôzôma bakteria na plasmid (fanovàna). Ny fototarazo koa dia azo afindra mitsivalana avy amin'ny bakteria iray mankany amin'ny iray hafa amin'ny alàlan'ny viriosy na bacteriophages (transduction), na amin'ny famindrana mivantana ny fototarazo avy amin'ny sela bakteria mpanome mankany amin'ny sela mpandray amin'ny alàlan'ny sex pilus (conjugation).
Na dia hita amin'ny ankamaroan'ny prokaryotes aza, ny famindrana fototarazo marindrano dia mifandray amin'ny eukaryotes ihany koa. Ny endosymbiose dia fantatra fa nandray anjara tamin'ny evolisiona eukaryotic tamin'ny alàlan'ny famindrana fototarazo bakteria-eukaryote. Ohatra maromaro momba ny famindrana fototarazo eukaryote-eukaryote no voarakitra an-tsoratra.
Zava-dehibe ny fisehoan'ny famindrana fototarazo marindrano satria mandray anjara amin'ny evolisiona. Ohatra, Ity dia tompon'andraikitra amin'ny fivoaran'ny bakteria mahatohitra antibiotika/mahatohitra fanafody marobe izay olana lehibe amin'ny fahasalamam-bahoaka. Eo amin'ny fambolena, ny andraikitry ny famindrana fototarazo marindrano eo amin'ireo karazana fungi mifandray dia efa ela no ahiahiana amin'ny firongatry ny fihanaky ny areti-mifindra kafe.
Ny aretin'ny kafe
Ny kafe dia vokatra ara-barotra lehibe. Tombanana ho 223 lavitrisa dolara eo ho eo ny haben'ny tsenany manerantany. Ny zavamaniry kafe dia an'ny karazana Coffea. Manana karazany maro izy io, fa ny karazana Arabica sy Robusta no malaza indrindra amin'ny ankamaroan'ny famokarana manerantany. Kafe arabica mitentina 60-80% amin'ny famokarana kafe eran-tany, raha izany Coffea canephora (fantatra matetika amin'ny hoe Coffea robusta) 20-40% eo ho eo.
Ny aretin'ny kafe dia vokatry ny holatra entin'ny tany Fusarium xylarioides izay miditra amin'ny alalan'ny fakan'ny voly mba hanjanaka ny xylem manimba ny rindrin'ny sela mba hahazoana otrikaina. Izy io dia manakana ny fidiran'ny rano izay mitarika ho amin'ny fahalavoan'ny zavamaniry. Ny holatra mifandray Fusarium oxysporum dia otrikaretina entin'ny tany ihany koa izay miparitaka amin'ny tany misy poizina ary tompon'andraikitra amin'ny areti-mifindra amin'ny voly maro toy ny aretin'i Panama ao amin'ny akondro, ny voan'ny voatabia voatabia sns. F. oxysporum miaina amin'ny zavamaniry hafa (toy ny akondro) mifanelanelana amin'ny kafe ho alokaloka fa mizara kafe ho mpampiantrano azy F. xylaroides.
Nanomboka tamin'ny taona 1920, ny voly kafe any Afrika dia niharan'ny fihanaky ny areti-maso tsindraindray izay misy fiantraikany manimba amin'ny kafe. famokarana ary ny fiveloman'ny tantsaha, indrindra any Etiopia sy Afrika afovoany. Ny fipoahana voalohany indrindra tamin'ny taona 1920 dia nahomby tamin'ny fampiasana fomba mety, saingy nipoitra indray ilay aretina tamin'ny taona 2000. Nanao ny holatra causative Fusarium xylarioides mandalo ny evolisiona taorian'ny fipoahana voalohany tamin'ny taona 1920 mba hanamafisana ny fahafahan'ny fifindran'ny zavamaniry kafe mitarika amin'ny fipoiran'ny valan'aretina indray? Nisy ny toromarika avy amin'ny fanadihadiana momba izany F. xylaroides fototarazo nahazo mba hanatsarana ny fahaiza-mifindra monina.
Ny fandalinana génomika ara-tantara navoaka tamin'ny taona 2021 dia nanohana ny hevitra fa ny zavamaniry kafe arabica sy robusta dia nahazo ampahany amin'ny fototarazo misy fiantraikany amin'ny alàlan'ny famindrana horizontaly avy F. oxysporum. Ny fototarazo effector dia mametraka molekiola tafiditra amin'ny fananganana aretina. Ireo fototarazo ireo dia aseho mandritra ny androm-piainan'ny holatra mba hanohanana ny fizotry ny aretina.
Tamin'ny fanadihadiana vao haingana navoaka tamin'ny 5 Desambra 2024, ny mpikaroka dia nanao famakafakana génomika fampitahana amin'ny karazany 13 manan-tantara. F. oxysporum mba hahatakarana ny fomba nivoahan'ny aretina miteraka holatra sy nifanaraka tamin'ny zavamaniry kafe mpampiantrano azy. Hita izany F. Xylarioides manana tsipika efatra miavaka: ny iray namboarina tamin'ny zavamaniry kafe arabica, ny iray namboarina tamin'ny zavamaniry kafe robusta, ary ny roa manan-tantara izay niaina tamin'ny karazana kafe mifandray. Fanampin'izany, nahazo fototarazo manakiana avy amin'ny mifandraika amin'izany ireo karazany ireo F. oxysporum, izay nahatonga ny aretina F. xylaroides handrava ny rindrin'ny selan'ny zava-maniry kafe mba hahatonga aretina malazo. Ny fifindran'ny fototarazo marindrano eukaryote-eukaryote avy amin'ny F. oxysporum ny F. xylaroides namela ny taloha hamindra ny zavamaniry kafe amin`ny fomba mahomby mahatonga ny firongatry ny aretin'ny Kafe.
Ity fahatakarana ny fomba nahatonga ny aretina ity dia mety hanampy amin'ny fanitsiana tsara ny fomba fambolena sy ny fitantanana ny aretin'ny zavamaniry amin'ny fomba mahomby kokoa.
***
References:
- Oniversite Colorado Denver. Fifindran'ny Gene mitsivalana - torolalana momba ny asa. Misy amin'ny https://www.ucdenver.edu/docs/librariesprovider132/a-sync_sl/genetics/upload-2/bacterial-genetics/horizontal-gene-transfer-activity-guide.pdf
- Keeling, P., Palmer, J. Fifindran'ny génétique horizontal amin'ny evolisiona eukaryotic. Nat Rev Genet 9, 605–618 (2008). https://doi.org/10.1038/nrg2386
- Peck, LD, et al. Ny génomika ara-tantara dia manambara ny mekanika evolisiona ao ambadiky ny fihanaky ny valan'aretina Fusarium xylarioides manokana amin'ny kafe. BMC Genomics 22, 404 (2021). Navoaka: 04 Jona 2021. DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-021-07700-4
- Peck LD, et al. Ny fifindrana mitsivalana eo amin'ny karazana Fusarium fungal dia nahatonga ny fiparitahan'ny aretin'ny kafe. PLoS Biology. Navoaka: 5 Desambra 2024. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3002480
***
